Projets RMN Saclay : une mutualisation des moyens, un partage des compétences
Il est l’un des 8 projets SESAME de l’Université Paris-Saclay, sélectionnés par la région.
SESAME : soutien régional aux projets de recherche
Un financement de 400 000 euros de la part de la région Ile de France, une contribution financière de partenaires privés (Servier), de partenaires publics : CEA, ENS Paris-Saclay et du réseau d'infrastructure national FRISBI dont font partie les trois équipes, vont permettre le regroupement sur un même site, dans des conditions optimales, des appareils de RMN des groupes de l'Université Paris Saclay, qui travaillent dans le domaine de l'étude spectroscopique des macromolécules biologiques.
Un tel regroupement des appareils devrait entrainer des économies importantes en termes d'installation, de gestion des appareils (notamment pour optimiser les consommations de fluides) mais permettre aussi un échange plus important entre les différents groupes, chacun de ces groupes possédant un domaine d'expertise propre.
Appareils RMN équipés de « cryoplateformes »
Le déménagement de l'ENS depuis Cachan sur le plateau de Saclay, et une partie des équipes du CEA sur le site de Gif-sur-Yvette (I2BC) avec leurs installations (2 RMN 600, 700 MHz), offrent la possibilité d'un regroupement de tous les appareils sur un même site : celui de l'ICSN qui possède une capacité suffisante pour accueillir l’ensemble du matériel.
Deux appareils supplémentaires, obtenus grâce à ce financement, seront équipés de "cryoplateformes" et également d'une sonde fluor très utile pour plusieurs équipes.
Ce dispositif, existant depuis une dizaine d'années, consiste à travailler avec des sondes de mesures RMN qui sont refroidies à des températures cryogéniques (de l'ordre de 20 degrés Kelvin (-253 °C); notons que seule la sonde de mesure et non l'échantillon est refroidie). Ce refroidissement permet d'éliminer en grande partie le bruit thermique des outils de détection et de gagner en rapport signal sur bruit, diminuant de façon très importante la durée des expériences.
Recherches du LBPA
Au sein du Laboratoire Biologie et Pharmacologie Appliquée, l'obtention de ce matériel permettra donc à l'équipe "Structures et Interactions des Acides Nucléiques", menée par Olivier Mauffret, de continuer à développer ses projets RMN dans les meilleures conditions.
Parmi les projets importants du groupe figure l'étude des propriétés structurales et dynamiques de la protéine de nucléocapside du VIH-1, une protéine rétrovirale essentielle impliquée dans plusieurs étapes du cycle de réplication du VIH-1. Cette recherche a pour objectif de mieux comprendre les caractéristiques de cette protéine afin de développer des inhibiteurs sélectifs.
Autre projet majeur pour l’équipe : l'étude des tétrades de guanines et des hélicases spécialisées dans leur destabilisation.
Les tetrads de G des structures d'ADN particulières fortement différentes de la double hélice et dont l'existence in vivo a été bien démontrée ces dernières années, leur reconnaissance par plusieurs types de protéines dont des hélicases est examinée.
L’étude des processus de formation et de stabilité du nucléosome l'unité fondamentale de compaction de la chromatine, correspond au 3e axe de recherche de l’équipe.
Représentation schématique du système de refroidissement cryogénique consistant du compresseur d'hélium (à droite), du système de refroidissement cryogénique et de la sonde cryogénique qui se trouve à l'intérieur de l'aimant.
La sonde est refroidie à 20K mains l'échantillon peut être à temperature ambiante (ou à 37¨C).